| Antibiotikaresistens - övervakning i Sverige: ResNet | Antimicrobial resistance - surveillance in Sweden: ResNet | |
|
The program quite often respond as shown below ... just do what it asks you to do: "click here"
Another recurring and hitherto unsolved problem is that it sometimes signals a "Failed to...." - just press the reload button a few times and most often it will respond.
To use ResNet you need to know something of Swedish Susceptibility Testing. |
||
| Begränsning: Lokala data måste tolkas med stor försiktighet eftersom underlaget i många fall är för litet för att man ska kunna dra säkra slutsatser om förändringar över tid”. | Disclaimer: Local data should be interpreted with caution since in many cases the number of investigated isolates is limited. | |
|
Att söka i ResNet: ResNet bygger oftast på svenska laboratoriers
resistensbestämning av bakterier isolerade i konsekutiva
rutinodlingar. Detta dokument ger vägledning till hur man bäst söker i
ResNet. Att samla och registrera resultat i ResNet: Svenska laboratorier samlar oh registrerar resultat till ResNet. Hur detta bör gå till regöres för i ett särskilt dokument - Att samla och registrera resultat i ResNet. |
ResNet is based on
routine susceptibility testing in Swedish laboratories. However, ResNet
prents only quantitative data and the data is quality assured through the joint action between
Swedish microbiological laboratories and the Swedish Reference Group of
Antibiotics´ subcommittee on methodology, SRGA-M. The advice below on how to successfully find information on the type of resistance you are looking for should be read before you go on to ResNet itself. |
|
|
1. Staphylococcus aureus
|
|
|
2. Streptococcus pneumoniae
|
|
|
3. Streptococcus pyogenes
|
|
|
4. Haemophilus influenzae
|
|
|
5. Escherichia coli
|
|
|
Neisseria gonorrhoeae skickas i stor utsträckning för typning och resistensbestämning till Neisseria-laboratoriet, Klinisk mikrobiologi, Universitetssjukhuset i Örebro. Laboratoriet visar årliga MIC-distributioner av kliniska isolat. Välj datakollektion "samtliga", antibiotika "samtliga" och årtal "samtliga" för att erhålla en lista över alla tillgängliga data.
|
6. Neisseria gonorrhoeae Neisseria gonorrhoeae isolated in Sweden are to a large extent sent to the Dept for Neisseria at Clinical microbiology, University hospital, Örebro in Sweden, for typing and susceptibility testing. The Neisseria laboratory displays yearly MIC-distributions of clinical isolates found in Sweden. Chose datacollection "all", antibiotics "all" and year "all" to obtain a table of all the MIC-distributions available.
|
|
|
7. Salmonella, Shigella, Campylobacter För resistensövervakningen av Salmonella, Shigella och Campylobacter bedriver ett antal laboratorier i landet resistensbestämning av konsekutiva kliniska isolat (repeat samples uteslutna). |
7. Salmonella, Shigella, Campylobacter For the surveillance of antimicrobial resistance in Salmonella, Shigella and Campylobacter a number of Swedish laboratories perform susceptibility tests on consecutive clinical isolates (repeat samples excluded). |
|
För resistensövervakningen av Helicobacter pylori bedriver några laboratorier i landet resistensbestämning av konsekutiva kliniska isolat (repeat samples uteslutna). |
8. Helicobacter pylori For the surveillance of antimicrobial resistance in Helicobacter pylori a number of Swedish laboratories perform susceptibility tests on consecutive clinical isolates (repeat samples excluded). |
|
|
För
Enterococcus faecalis och Enterococcus faecium, Neisseria gonorrhoeae,
Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter spp,
Salmonella, Shigella, Campylobacter, Helicobacter m fl finns mer sporadisk
information än för ovan nämnda bakterier. |
Other bacteria For other bacteria than those above (Enterococcus
faecalis and Enterococcus faecium, Neisseria gonorrhoeae, Pseudomonas
aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter spp, Salmonella spp,
Shigella spp, Campylobacter, Helicobacter) the amount of information is
more limited. |
|
I Sverige har RAF-M (Referensgruppen för antibiotikafrågors metodgrupp) och Smittskyddsinstitutet (SMI) i samverkan med de svenska mikrobiologiska laboratorierna i Boden/Luleå (Sunderbyn), Borås, Eskilstuna, Falun, Gävle, Göteborg (Sahlgrenska universitetssjukhuset), Halmstad, Huddinge, Jönköping, Kalmar, Karlskrona, Karlstad, Kristianstad, Linköping, Lund, Malmö, Skövde, Stockholm (Karolinska sjukhuset, St Göran, Medilab), Sundsvall, Uddevalla, Umeå, Uppsala, Visby, Västerås, Växjö, Örebro och Östersund sedan flera år systematiskt övervakat antibiotikaresistens hos Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus, Escherichia coli och med jämna mellanrum också hos Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter spp., Pseudomonas aeruginosa och Stenotrophomonas maltophilia. Endast kvantitativa mätresultat (MIC och/eller zoner) har accepterats som underlag för denna resistensmätning. Resultaten har efter sammanställning på olika sätt distribuerats till svensk mikrobiologi och infektionsmedicin. De har också presenterats som grafer och tabeller i olika sammanhang (RAF- och RAF-M-dagar, STRAMA-dagar, SMI-dagar, Riksstämmor, Internationella kongresser mm). Nu har ARG-gruppen (Antibiotika Resistens Gruppen) vid SMI tillsammans med övriga intressenter skapat ett smidigt sätt att inhämta och presentera data över internet, ResNet. Ett sådant har tidigare saknats. ResNet har bekostats av SMI som också genom Generaldirektörens försorg ansvarar för att säkra programvara och databaser. Under sommaren 2002 "laddas" ResNet med data från föregående år. Det innebär att för flera av arterna kommer ResNet att redan från start presentera nästan 10 års nationella "kvalitetsmärkta" resistensdata. Respektera det faktum att laboratorierna i Sverige, i motsats till hur brukligt är, valt att inte vara anonyma i den kvalitetsgranskning som den publika presentationen av mätdata innebär. De data som laboratorierna bidrar med i den nationella övervakningen ägs gemensamt av laboratorierna, RAF-M och SMI. Varje deltagande laboratorium förfogar fullt ut över sina egna data. Laboratorierna namnges i alla presentationer av data. En lista över aktuella laboratorier finns också publicerad på ResNet´s hemsida. Den som vill använda samlade eller enstaka data från ResNet (undantag enstaka laboratorium som använder egna data) refererar i sin presentation till "Svensk resistensövervakning ResNet, årtal, http://www4.smittskydds-institutet.se" (data published on the Swedish antimicrobial resistance surveillance website, ResNet, year, http://www4.smittskyddsinstitutet.se"). |
In Sweden the
Swedish Reference Group of Antibiotics´ subcommittee on susceptibility
testing (SRGA-M) and the Swedish Institute for Infectious Diseases in
collaboration with the Swedish clinical microbiology laboratories in Boden/Luleå (Sunderbyn), Borås, Eskilstuna, Falun, Gävle, Göteborg (Sahlgrenska universitetssjukhuset), Halmstad, Huddinge, Jönköping, Kalmar, Karlskrona, Karlstad, Kristianstad, Linköping, Lund, Malmö, Skövde, Stockholm (Karolinska sjukhuset, St Göran, Medilab), Sundsvall, Uddevalla, Umeå, Uppsala, Visby, Västerås, Växjö, Örebro
and Östersund have performed systematic surveillance of resistance
development and testing proficiency for many years. Since 1994, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus
pyogenes and Haemophilus influenzae have been surveyed each year. Staphylococcus aureus, Escherichia coli,
Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter spp., Pseudomonas aeruginosa
and Stenotrophomonas maltophilia have been part of the surveys
on one or several occasions during this time. All results from 1994 and onwards will be available through ResNet by the end of 2002. The data shown on ResNet is jointly owned by the Swedish microbiological laboratories, The Swedish Reference Group of Antibiotics´ subcommittee on methodology (SRGA-M) and the The Swedish Institute for Infectious Disease Control. The names of the laboratories should be mentioned in presentations of data from ResNet (see above). Anyone who wishes to use collective or separate data from ResNet should refer to "Data from the Swedish antimicrobial resistance surveillance program - ResNet, year, http://www4.smittskyddsinstitutet.se".
|
|
Inmatningsrutiner är tillgänglig för den som givits behörighet att förse ResNet med data. Det innebär att alla svenska laboratorier erhållit behörighet och särskilda instruktioner för inmatning av data.
Sökrutiner är utan inloggningsförfarande och tillgängliga för alla!
Att använda sökrutinerna i ResNet?
|
Datakollektioner |
se nedan | |
|
Art |
se nedan | |
|
Antibiotikum |
se nedan | |
|
År |
se nedan | |
|
Sortera efter |
se nedan |
|
Datakollektion - välj om du vill söka "100-stamsstudier", "EARSS-data" eller "Övriga" eller "Samtliga" typer av data.
Art - här listas de arter för vilka resultat förekommer i databasen. Vanligen gör man klokt i att välja en art - inte "Alla". Undantag - om man i nästa två val (Antibiotikum och Årtal) väljer ett antibiotikum och ett årtal kan man i art-tabellen välja "alla arter" utan att i presentationen bli överväldigad av sökresultatet.
Antibiotikum - här listas de antibiotika för vilka resultat förekommer i databasen.
Om man i nästa val - Årtal - tänker välja endast ett årtal är det framgångsrikt att i antibiotikavalet ange "alla".
Om man i nästa val - Årtal - tänker välja "alla" bör man i antibiotikavalet vara selektiv för att inte sökningen ska bli ohanterlig.
År - välj ett eller alla. Väljer man alla kan det ta tid att sammanställa sökresultatet - förlora inte tålamodet. Ett tips är att välja ett och då gärna ett tidigare årtal - presentationen av sökresultatet går då ganska snabbt och i den skärmbild som presenterar sökningsresultatet kan man välja att titta på ett "alternativt årtal" eller ett "valfritt antal år framåt" - det sistnämnda ger för 100-stamsstudier en mycket användbar tabell med tidsmässigt och geografiskt sorterade data.
Sortera efter - den tabell som presenterar sökresultatet kan erhållas sorterad efter art, antibiotikum eller årtal.
Sökresultatet presenteras i en tabell där varje rad representerar antingen "en 100-stamsstudie" (vilket innebär att raden representerar en Sverige-karta med resultat från alla 30 laboratorier) eller ett enstaka material av typen "övrigt". Framför varje rad i tabellen visas SMI-logon. Markera SMI-logon för att se resultatet av sammanställningen.
Om tabell-raden representerar en 100-stamsstudie visas en Sverigekarta. I kartan är de olika länens individuella resultat representerade av en procent-siffra med eller utan en understrykning.
Siffrorna kan vara svarta, blå eller röda. Svart siffra innebär att resistensfrekvensen är oförändrad jämfört med föregående år; blå siffra att den sjunkit och röd siffra att den stigit. Tanken bakom detta är att man snabbt skall kunna skaffa sig en uppfattning om huruvida resistensen generellt ökat eller minskat i landet eller del av landet.
Understrukna siffror kan markeras för visning av demografisk tabell och graf enligt beskrivningen nedan. Icke understrukna siffror representerar ett enkelt genomsnitt av 2 - 4 laboratoriers resultat inom ett län (Skåne, Västra Götaland och Stockholm). De enstaka laboratoriernas resultat kan då sökas i tabellen vid sidan om kartan.
Under kartan och tabellen finns ett par mycket användbara knappar: byt art, antibiotikum eller årtal för sökningen samt "visa X antal år framåt". Exempelvis: en primär sökning gjordes för S.pyogenes, erytromycin och året 1994. Under Sverige-kartan väljer man "Visa 8 år framåt". En tabell med alla läns alla data för 9 år visas.
Genom att klicka på ett resultat (i karta eller tabell) visas dels en distribution av mätdata (zon-histogram eller MIC-histogram) och dels sammanställningen över de demografiska uppgifter som lämnades av det registrerande laboratoriet (se nedan).
Om antalet observationer överstiger 100 visas i grafen en Y-skala med sorten procent, annars med sorten "antal". Skalan på Y-axeln är alltid 0-50 (% eler antal) och på X-axeln 0-50 mm eller <0.002 - >256 mg/L.
Om man "högerklickar" på bilden ges möjlighet att kopiera eller spara bilden på den egna datorn under ett valfritt namn. Bilden kan sedan användas för presentationer (antingen via "infoga bild från fil" eller genom helt enkelt välja "klistra in" i Power-Point, Word, etc).

Demografiska uppgifter inklusive metod, använda brytpunkter, inklusioner och exklusioner mm visas i en tabell.
|
Art |
Campylobacter jejuni/coli |
|
Antibiotikum |
Erytromycin |
|
Insamlat år |
2000 |
|
100-stams |
Ja |
|
Metod |
Lappdiffusion - Oxoid-material (RAF) |
|
Andel resistenta |
2.8% |
|
S>= |
23mm |
|
R<= |
19mm |
|
Lappstyrka |
15µg |
|
Antal observationer |
145 |
|
Land |
Sverige |
|
Län |
Kronoberg |
|
Ursprung |
Öppen vård |
|
Patientålder |
Blandat |
|
Provtyp |
Feces |
|
Finns misstanke om epidemisk spridning av resistenta stammar under insamlingsperioden? |
Nej |
|
Har smittspårning kring resistenta indexfall förekommit under mätperioden? |
Nej |
|
Har upprepade prov från samma patient uteslutits? |
Ja |
|
Kommentar |
|
ResNet är öppet för alla. Sprid gärna kunskapen om existensen av ResNet och internet-adressen till ResNet (http://www4.smittskyddsinstitutet.se/ResNet/index.jsp). Länka gärna till ResNet från andra hemsidor.
För ARG-gruppen,
Gunnar Kahlmeter